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生物医药大数据使生命科学发生了根本性转变2022-03-08 09:16:57

生物医药大数据使生命科学的发展模式发生了根本性转变,开启了数据驱动的科学发展模式《科学》杂志。2013年10月发表评论文章《生物学的不湿手的未来》指出: “包含序列、结构、影像等的公开数据爆发性增长,使生命科学家可以在”不湿手“的条件下完成重大科学发现。① ”生物医药大数据已成为生物医药科学领域的“石油”,对生物医药大数据的分析、挖掘、转化和利用已如同对石油的开采和加工一样,是发现新知识、产生新技术、研发新应用的重要途径和动力来源。

国外生物医药大数据相关战略规划
对生物医药大数据的利用水平取决于对生物医药大数据技术掌握程度。通过生物医药大数据管理、集成、共享、分析、转化和标准化等核心算法与系统技术,可有效地将价值密度较低的生物医药大数据转化为具有价值密度较高的生物医药科学数据和知识并迅速得到利用,从而使数据形成先进生产力,带动生命科学及相关产业发展。在世界范围内对生物医药大数据的研究和利用正进入高速发展时期,世界各主要科技强国纷纷启动大数据研究计划,并建立专门的生物医药大数据研究机构,发展生物医药大数据核心技术,提升本国对生物医药大数据的利用水平。
 
美国生物医药大数据研究计划方面的部署情况
美国 NIH 在 2003 年实施路线图计划,用于发展转化医学技术与应用。在该计划支持下,NIH建立了8个国家生物医药大数据管理与服务技术研究中心,进行生物医药大数据分析与服务技术的研究,旨在突破生物医学领域发展的技术瓶颈,为未来生物医学服务奠定技术基础。2012 年美国奥巴马政府提出的世界第一个国家大数据计划中将生物医药大数据列为六个重要大数据领域之一。美国 NIH 又于2014年启动了专门的国家生命大数据计划(即BD2K 计划),投入大量资金(2018财年投入达2200万美元) 进行生物医药大数据关键基础技术研发。同时,美国NIH在战略发展计划中,将“数据科学”列入重要基础发展方向。
 
欧美发达国家重视生物医药大数据资源的掌控和垄断
早在上世纪 80 ~ 90 年代,美国、欧洲和日本就分别建立了各自的国家生物数据中心,即美国国家生物技术信息中心( NCBI) 、欧洲生物信息研究所( EBI) 、日本 DNA 数据库( DDBJ) 。目前,这三个数据中心已经成为世界最大的三个生物医药大数据管理机构,各自建立重要生物医学数据库近百个,提供数据服务数十项,这些数据库和生物医学数据服务已经成为当前生物医药科学领域发展必不可少的数据资源。在三大生物数据中心基础上,欧美等国近年来又在建立新的生命大数据中心,提升生命大数据管控和利用能力。美国在 BD2K 计划支持下,正在建立新的国家生命大数据中心( LINCS-DCIC) ,用于管理美国和世界的生物医药大数据资源①,以继续掌控、利用生物医药大数据推动领域发展②。欧盟也在地平线 2020( Horizon 2020) 计划支持下,建设了 Elixir 平台,管理和共享全欧洲的生物与医疗大数据③。目前该平台正在整合欧洲15 个国家的生物医学数据资源④,建立统一的生命大数据管理与共享网络,提供生命大数据管理、共享与分析服务。
 
出自《生物医药大数据: 发展现状与政策建议》作者张大璐,李萍萍,潘子奇。