单细胞测序对组织特异性干细胞的研究分析2021-09-24 09:26:06
组织特异性干细胞是一类存在于发育中或分化组织中的干细胞, 同样具备自我更新和分化为特异性细胞的潜能。用微流控单细胞测序技术对来自肺泡分化中4个不同阶段的198个细胞进行了转录组分析, 确定了小鼠远端肺上皮的发育状态和细胞层次, 发现一种新的干细胞类型—一种肺泡1型和肺泡2型的标记基因共同表达的干细胞亚型, 具有同时分化肺泡1型和肺泡2型的潜能。造血干细胞可以分为长期造血干细和短期造血干细胞。KOWALCZYK等和TSANG等的研究发现, 细胞周期的差异导致了不同类型造血干细胞的细胞异质性, 他们利用单细胞转录组的测序数据重建了HSCs的细胞周期过程, 为研究静止期和增殖期的干细胞特性提供了一种新的方法。成年哺乳动物大脑中脑室下区和齿状回颗粒下区的神经干细胞可不断生成新的神经元和胶质细胞。神经发生过程从静止的神经干细胞开始, 成为激活的神经干细胞, 随后成为早期的中间祖细胞。SHIN等利用“拟时间”方法分析单细胞转录组数据, 绘制出神经干细胞从静止到激活再分化为早期中间祖细胞的神经元发生轨迹。
研究获得相似的结果, 这两项研究都是在给定的时间点对组织中一定数量的单细胞进行测序, 这表明, 利用单细胞测序技术可以描绘出发育过程中转录组动态的谱图。TANG课题组利用单细胞测序技术分别对肾脏和食道、胃、小肠、大肠的发育进程在基因表达调控层面进行解析, 绘制出了肾脏和消化道的发育细胞图谱, 为鉴定组织特异性干细胞分化的基因表达特征提供一定的依据。
出自《单细胞测序技术在干细胞领域的研究进展》作者刘芳远,苏秀兰。
上一篇: 单细胞测序对肿瘤干细胞的研究分析
下一篇: 单细胞测序技术的快速发展