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单细胞的单组学分析2021-09-24 09:48:37

单细胞全基因组测序:单细胞全基因组测序是在单细胞分离技术基础之上, 获取单个细胞全基因组DNA, 扩增后完成测序, 从而获得单个细胞的全部基因信息, 该技术常被用于获取细胞之间异质性信息和探索细胞群体之间的进化关系。

使用单细胞DNA测序方法来表征9个胃癌细胞系的细胞多样性, 并将这一信息与单细胞RNA测序相结合, 独立地证实了88%的单细胞克隆结构。但通常一个细胞内只有1~2个DNA拷贝, 所以单细胞全基因组扩增技术的发展较慢。
 
单细胞转录组测序:转录组广义上指某一研究对象在特定时间和环境内所有转录产物的总和 , 包括编码 RNA和非编码 RNA; 狭义上指所有mRNA的总和。单细胞RNA测序技术需要获取单个细胞的全部转录产物, 构建成cDNA文库, 然后再进行测序, 从而获得单细胞的转录组图谱, 该方法可以准确地辨别处于不同状态或发展阶段的细胞, 揭示其基因表达的动态变化。为了尽可能多的捕获单细胞转录产物, 通常实验中会选择将转录产物反转录成cDNA。2018年, 研究中应用单细胞 RNA测序对斑马鱼胚胎发育第一天的92 000个细胞进行测序, 并构建了斑马鱼完整的细胞分化轨迹。
 
出自《单细胞测序技术在生殖研究中的应用》作者高山凤,肖轩,张玲羽。