该课题组利用 DR-seq分别对小鼠胚胎干细胞系（E14）和乳腺癌细胞系（SK-BR-3）进行了测序发现，细胞到细胞之间基因的变化程度与拷贝数变异呈负相关趋势，表明拷贝数变异可能驱动个体细胞的基因表达。但这个方法存在不能完全隔离开DNA和RNA的问题，无法避免相互干扰的风险。另一种基因组与转录组同时测序的G＆T-seq技术由Macaulay等报道，该课题组利用G＆T-seq 技术对已经基因组测序的乳腺癌细胞和B淋巴母细胞系再次测序发现，B淋巴母细胞中存在11号染色体三体的细胞亚群。
 

同时对分裂期的小鼠胚胎细胞和诱导多能干细胞进行测序，明确了细胞分裂中染色体的错配与染色体表达量的关系，表明该测序方法可获得的信息远远超过之前的测序方法。随着技术的不断成熟，单细胞三组学测序（scTrio-seq）也逐渐为人们所用，它是将细胞裂解液的上清液进行转录组测序，而对裂解物沉淀进行基因组和 DNA 甲基化测序的方法，Hou等利用其对25个来源于人肝细胞癌组织的单细胞进行基因组、甲基化组和转录组同时测序，跟据 CNVs，DNA 甲基化和单个细胞转录组确定了肝细胞癌的两个细胞亚群，揭开了每个细胞亚群之间存在的异质性差异。
 

另外，Bian等在结直肠肿瘤病人原发瘤、淋巴结和远处转移瘤的多部位取样，运用优化的单细胞多组测序方法（scTrio-seq2），进一步了解结直肠肿瘤的内部异质性。因此多组学同时测序的方法能为人们提供更加全面综合的视野。
 

出自《单细胞测序技术在肝脏疾病的应用与展望》作者过冬冬,孙芬,贺轩昂。