例如，于2017年使用DNA聚合酶的热稳定突变体提高了单细胞基因组测序的覆盖度 ；哈佛大学谢晓亮团队于2012年发明了多次退火环状循环扩增技术，通过拟线性的扩增过程降低了指数扩增的序列偏好性。发展至今，单细胞测序技术在神经生物学、微生物学、胚胎发育、器官发生和免疫学研究中取得了广泛应用，临床上也已用于辅助生殖和肿瘤的诊断与治疗。Nature Methods于 2011年将单细胞研究方法列入最值得关注的技术领域，又于 2013 年将相关应用列为年度最重要的方法学进展 ；近日 Nature再次将单细胞测序技术评为 2020 年度最受期待的技术之一。相比扩增子测序和宏基因组测序，单细胞扩增和测序技术有其独特的不可替代的优点。
 

扩增子测序是指对微生物的特定基因进行测序，传统针对 16S rDNA、18S rDNA 或 ITS（内转录间隔区）基因进行的扩增子测序虽然可以满足检测微生物群落多样性的需求，但这种方法很难准确鉴定到属以下的分类等级，也无法深入探究物种的功能信息。宏基因组测序又称环境基因组测序或群落基因组测序，直接对样本中所有微生物的全基因组进行测序，可以同时对物种和功能基因做出鉴定，也有助于发掘潜在代谢途径。然而该方法容易忽视某些稀有种，且测序结果的组装也始终是一大难题。如果说宏基因组数据集是捕获整个群落信息的一张巨网，那么单细胞测序方法则是分离目标基因组的“手术刀”和深入探究目标群落的“放大镜”，能不断细化、深化我们对微生物群落的认识。
 

 

出自《单细胞测序技术在微生物生态领域中的应用》作者王丹蕊,沈文丽,魏子艳。