单细胞测序在肿瘤方向中的研究2021-09-30 11:24:10
首先应用最广的是肿瘤方向的研究,在肿瘤研究中的应用表明,遗传或基因组变异可导致肿瘤组织内具有不同遗传和表型特征的细胞,使肿瘤组织具有高度异质性。 这种高度的异质性可能与肿瘤发生和转移的机制有关,传统的测序方法只能检测到细胞的数量,得到一组细胞的平均信号,掩盖肿瘤细胞的异质性。 单细胞测序技术可以很好的弥补传统测序方法的不足,通过检测肿瘤细胞的异质性,绘制肿瘤细胞与肿瘤微环境的细胞图谱,进一步明确肿瘤组织内的细胞群,寻找特异性标志物,解释肿瘤发生、 转移等一系列问题。最早 Navin等使用单细胞 mRNA 测序(scRNA-seq)了解乳腺癌的起源首次单核测序分析基因组拷贝数变异,研究2例乳腺癌患者的肿瘤种群结构和进化。 结果在肿瘤中发现了间断的克隆进化,并证实了转移细胞是从主要的晚期扩展中出现的。 近期,Zhang等对结直肠癌患者的免疫和基质人群进行了 scRNAseq 分析,确定了特异性巨噬细胞和常规树突状细胞(cDC)亚群作为肿瘤微环境中细胞串音的关键递质。 在小鼠肿瘤中定义可比较的髓细胞群,能够表征它们对髓细胞靶向免疫治疗的反应。
他们使用抗csf1r 的具有炎性反应信号的优先耗竭巨噬细胞进行治疗,但保留小鼠和人类中表达促血管生成/ 致瘤基因的巨噬细胞群,CD40激动剂抗体的治疗优先激活cDC人群,增加 Bhlhe40类th1细胞和CD8记忆T细胞。这项发现对人和小鼠关键的骨髓亚群的综合分析确定了调节肿瘤免疫的关键细胞相互作用,并确定了髓样靶向免疫治疗的机制。 综上所述,单细胞测序在探究肿瘤的发生和转移具有独特的优势。
出自《单细胞测序技术与中医药前沿研究》作者李捷,唐勇,刘洁。
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