单细胞测序应用于中药作用机制的研究2021-09-30 13:42:17
几千年的中医药学有其独特的优势,但受到有效成分及作用机制不明确等因素影响而不能被西医体系所普遍接受。 因此,在中药研究方面,筛选治疗疾病的有效药物并探讨其作用机制历来是其重要内容。 目前,由于出现了系统的多靶点药物设计策略,全球对传统草药的兴趣有所增加。 中药成分、相应的蛋白靶点、靶点参与的生物过程、药物靶点相互作用和靶点-靶点相互作用是了解中药分子机制的必要条件。单细胞测序完善了各类相关数据库。 由于基于网络的多靶点药物设计方法可以整合不同平台上的相关信息,因此,它们将更有助对比分析出中药治疗疾病的作用机制。 Sun Y 等以阿尔茨海默病(AD)中草药研究为例,通过对临床试验抗 AD 中草药的研究,论证了基于网络的中医不同数据源整合的价值,提示雪莲可能主要通过改善症状的方式产生抗阿尔兹海默作用,而丹参的作用靶点主要参与炎性反应和癌相关通路,银杏在这些的基本途径中靶点分布更为多样化,表明其抗阿尔兹海默作用更为广泛。单细胞测序在中药物种鉴定、种质资源开发和系统发育关系等方面的研究也具有独特的优势,如:AiHL等利用单细胞测序和基因组装算法的出常见中药射干的完整的质体基因组。 瓜蒌,是治疗各种疾病的基本中药。 Yang等研究已经确定了该菌叶绿体基因组的完整序列。 总基因组长度为157481 bp,包含一对26268 bp 的反向重复序列(IRs),分别被大单拷贝(LSC)和小单拷贝(SSC)分离,分别为86478bp和18467bp。
共预测130个基因,其中蛋白编码基因85个,rRNA 基因8个,tRNA 基因37个。 进一步的系统发育分析证实了天牛属葫芦科。 其完整的叶绿体基因组将在植物系统发育和种群遗传研究的分子标记开发中发挥重要作用。 基于网络的各种数据库和组学数据的整合,这不仅有助于对疾病发病机制的整体理解,而且为今后中药在药物发现中的应用提供了新的线索。
出自《单细胞测序技术与中医药前沿研究》作者李捷,唐勇,刘洁。
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