核孔蛋白对特定基因转录的调控作用2024-05-27 08:47:56
对于神经祖细胞的全基因组分析表明，Nup153和Sox2结合并共同调控数百个基因。Nup153与基因启动子或转录末端位点的结合分别与基因表达的增加或减少相关，而抑制Nup153表达可以改变染色质的开放构型，破坏Sox2的基因组定位，体外和体内均可调控胶质细胞命运。对于 NPC相关的染色质结构和功能研究主要关注特定核孔蛋白对特定基因转录的调控作用。在酵母中进行的一项早期全基因组研究中，Nup2、Nup60和Nup145等特定核孔蛋白表现出与GAL1、GAL2、HXK1、INO1等具有高转录活性基因的相关性，基因被激活后优先定位于核外周区域。通过乳糖操纵子系统检测核孔蛋白Sec13和Nup62与紧密折叠异染色质区域的靶向互作，发现核孔蛋白Sec13和Nup62导致凝结染色质解压缩，这一实验为核孔蛋白诱导染色质开放提供了重要证据。从机理上讲，核孔蛋白诱导的染色质开放依赖核孔蛋白Elys，并且需要依赖ATP的染色质重塑BRM复合物。线虫中进行的研究确定了Elys的同源物MEL-28与SWI/SNF染色质重塑复合体之间的相互作用。
少突胶质细胞中Sec13结构同源物Seh1也被发现与Brd7等染色质重塑因子的互作关系。Seh1的缺失会诱导染色质的压实，导致染色质可及性降低。另有研究发现，Nup98与修饰H3K4的组蛋白甲基转移酶之间存在相互作用。核孔蛋白与染色质相互作用在转录记忆的分子机制中具有重要作用。通过转录记忆过程，之前激活的基因在经过一段时间的抑制后，在后续激活时会做出更强的反应。Nup98同源物是不同物种特定基因的转录记忆和动态再激活所必需的，包括酵母中肌醇诱导的INO1基因和人体细胞中干扰素-γ诱导的基因。
出自《细胞核生物力学研究进展》作者:刘中乾 齐颖新.
上一篇： 核孔蛋白对增强子的靶向性
下一篇： 生物大分子或受体和配体之间的相互作用
