scRNA-seq技术突破群体细胞的平均基因表达水平限制2024-11-14 08:42:01
细胞是生物体的基本结构和功能单位。细胞间的相互作用不仅对维持组织稳态至关重要,也是生物体对外界环境变化做出适应性反应的基础。传统研究常基于组织中细胞群体的平均特征来分析,而单细胞转录组技术则是聚焦于单个细胞,为揭示细胞亚群的异质性提供了更多可能性。细胞异质性的发现对于解析生物体的复杂性和疾病机制至关重要,尤其是在脂肪组织的研究中,细胞异质性的研究得到了深入探讨。传统研究脂肪细胞异质性的方法,如遗传谱系示踪技术、荧光激活细胞分选、体外培养细胞模型和传统RNA测序,在揭示脂肪组织中细胞亚群的分子机制和功能方面存在一定的局限性,但仍为脂肪组织的研究提供了重要基础。而单细胞转录组学技术如单细胞RNA测序和单细胞核RNA测序,能够在单细胞水平上深入分析脂肪细胞的异质性和多样性,以识别可能涉及脂肪细胞功能及其功能障碍的新细胞类型和基因表达模式。
与传统的RNA测序不同,scRNA-seq技术突破了群体细胞的平均基因表达水平限制,直接聚焦在单个细胞的基因表达上,从而揭示细胞的异质性和稀有细胞群体的信息。成熟脂肪细胞内富含脂滴,同时其细胞膜相对较薄且脆弱,在机械或酶解解离过程中容易破裂并释放出脂滴,导致细胞受损和RNA降解,从而影响下游的cDNA合成和测序。为了避免这一问题,越来越多的研究开始转向或结合采用snRNA-seq技术。本文将探讨单细胞转录组学技术如何揭示脂肪组织中各种细胞类型亚群及其相互作用机制与细胞分化命运轨迹,为疾病治疗提供新的视角和潜在的干预靶点。
出自《单细胞转录组学视角下的脂肪组织异质性》作者:王永浪,陈思思,李奇隆.
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