脂肪组织的异质性不仅体现在不同类型脂肪组织的解剖位置及其功能差异上，同时还反映在其细胞类型组成方面。除成熟脂肪细胞外，脂肪组织还包含基质血管部分,其中包括脂肪祖细胞、免疫细胞、内皮细胞和血管祖细胞等多种细胞类型。此外，即使在同一种脂肪组织中，每一种细胞类型也可能存在不同亚群。scRNA-seq是一种能够对单个细胞的转录组进行全面分析的高通量测序技术，可以检测到细胞内所有RNA分子，而snRNA-seq则是一种专注于从单个细胞核中提取RNA进行分析的测序技术。
 

由于核中的RNA主要包含未成熟的转录本和一些特定的成熟mRNA，因此snRNA-seq可能无法捕捉到细胞质中的全部转录组信息，但snRNA-seq在处理难以分离的细胞类型（如脆弱的脂肪细胞）时可能更有优势。此外，snRNA-seq在检测长基因方面存在优势，因为长基因通常含有更多的内含子poly序列，这可能导致在核中更容易被检测到。其次，snRNA-seq能够识别scRNA-seq中所观察到的细胞类型，但存在一些固有的偏差，如转录本富集和检测偏差。尽管snRNA-seq在某些方面存在局限性，但它为研究难以通过scRNA-seq分析的细胞类型提供了一种有效的替代方法，并且使用scVI等生物信息学工具可以将scRNA-seq 和snRNA-seq 数据集进行整合以获得更全面的细胞图谱。
 

出自《单细胞转录组学视角下的脂肪组织异质性》作者:王永浪,陈思思,李奇隆.