胃肠道内存在多种的微生物群落，包括细菌、真菌和病毒，这些微生物群落构成了肠道微生物群。肠道干细胞是机体与微生物相互作用的主要场所，其再生是由一些快速循环的干细胞完成的，其自我更新和增殖受生长因子和肠道微生物的调控。此外，肠道蠕虫与肠上皮直接存在紧密的物理连接，蠕虫的分泌抗原也可以引起肠道的重塑，甚至可以诱导胚胎样的再生干细胞。
 

肠道内的膳食纤维在肠道微生物作用下生成发酵产物SCFAs，根据所含碳原子的数量，可以将其划分为：甲酸（C1）、乙酸（C2）、丙酸（C3）、异丁酸（C4）、丁酸（C4）、异戊酸（C5）和戊酸（C5）。乙酸是醋的主要成分，在人体肠道内可以由普雷沃氏菌属、链球菌属、拟杆菌属、双歧杆菌属、梭菌属等菌株产生，它能结合辅酶A参与细胞内脂肪和碳水化合物的代谢途径。与其他 SCFAs 相比，乙酸在血液和结肠中的浓度较高。
 

最近的研究发现，小鼠感染蛔虫后，通过其寄生虫源性分子如醋酸盐可直接作用于上皮细胞，导致幼虫入侵，并引起ISCs的局部耗损。丁酸是共生菌产生的一种主要代谢产物，在一定的生理浓度条件下，依赖转录因子Foxo3，抑制ISCs和祖细胞的增殖；稳态状态下，分化的结肠细胞能代谢丁酸，降低肠道中丁酸的浓度，以保护肠隐窝处的干细胞。丙酸对免疫和代谢具有调节作用，对健康有益。多形拟杆菌和阿克曼菌等关键肠道细菌能产生丙酸，相关研究报道显示拟杆菌中的关键酶—甲基丙二酰-辅酶A变位酶可以参与丙酸的合成，并促进肠道杯状细胞分化和黏液完整性，从而有助于抵抗结肠炎，维持肠道稳态。
 

出自《肠道共生生物对肠道干细胞的调节机制研究进展》作者:丁莹莹，张嘉芸，唐龙轩.