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问:单细胞表观遗传学测序是什么?2021-09-24 10:23:16

答:近年来,表观遗传学的研究已成为人们从分子水平上了解细胞行为的重要生物学分支。表观修饰为人们理解由基因组和转录组控制的细胞行为之外的行为提供了途径。DNA甲基化在表观遗传中起着重要作用,而哺乳动物中5-胞嘧啶甲基化(5mC)则在DNA甲基化中占主导地位,因此利用单细胞测序技术测定DNA甲基化程度十分必要。当前亚硫酸氢盐测序的原理是利用亚硫酸氢钠处理DNA后将未修饰的胞嘧啶转化为尿嘧啶,但不影响 5mC。基于还原替代亚硫酸氢盐测序和全基因组重亚硫酸盐处理后的接头和引物扩增测序策略,建立了单细胞DNA甲基化组谱分析方法,避免了DNA丢失,确保下一代基因测序中覆盖整个基因组。
 
亚硫酸氢盐处理后的DNA再经过PCR扩增,至满足后续测序要求再测序。如已普及的ATAC-seq技术,通过识别开放染色质并引入引物在染色质开放区域进行高通量测序达到对单细胞表观遗传修饰进行测序的目的,这是一种集细胞捕获、文库建立与测序一体的技术,大大简化了测序的过程。
 
出自《单细胞测序技术在肝脏疾病的应用与展望》作者过冬冬,孙芬,贺轩昂。