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问:脂肪细胞分化的拟时序分析是怎样的?2021-09-28 15:14:53

答:scRNA-seq拟时序分析可以对处于发育过程中细胞的瞬时状态进行表征, 其通过特定算法了解基因表达变化的整体“轨迹”, 然后将每个细胞放置在轨迹中的适当位置, 从而重现细胞重编程的过程并分析这一过程中受调控的关键基因。BURL等发现, β肾上腺素受体激动剂处理引起增殖型和分化型的脂肪干细胞亚群增加, 对这两群细胞进行拟时序分析, 发现可分别对应干细胞增殖、早期成脂分化和晚期成脂分化三个阶段, 清晰地重现了脂肪干细胞向米色脂肪细胞分化的轨迹, 并鉴定了多个与分化轨迹相关的基因。拟时序分析对于揭示脂肪祖细胞的发育层次结构具有重要的作用, 在早期脂肪形成过程中DPP4+亚群细胞可转变为ICAM1+和CD142+前脂肪细胞, 进而分化为脂肪细胞 干预这些细胞亚群中的一个或多个群体或可促进脂肪适应性扩张以改善代谢疾病。

出自《单细胞测序技术在脂肪组织研究中的应用》作者胡帆 杨颖。