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问:怎样鉴定关键细胞亚群?2023-02-13 10:01:47

答:肌内脂肪细胞的起源目前尚不完全清楚,长期以来,肌内脂肪细胞被认为起源于肌卫星细胞,但这一观点一直备受质疑,Lyu等利用scRNA-seq技术对牛卫星细胞进行聚类分群,研究结果表明,牛卫星细胞亚群的肌源性状态不同,其中2个细胞亚群富含血小板源性生长因子受体A被认定为纤维-脂肪前体细胞,该研究为牛肌内脂肪细胞来源于纤维脂肪细胞的假说提供了证据,支持肌内脂肪细胞起源于肌卫星细胞的观点,同时也为改善牛骨骼肌生长发育以及肌内脂肪含量提供了新的思路。

上述卫星细胞的亚群聚类结果与vanden Brink等研究结论一致,但后者指出,细胞亚群的聚类结果有可能会受到细胞分离方法的强烈影响,并且细胞分离方法对转录组分析结果的影响在诸多的研究中经常被忽视。细胞亚群的聚类结果除受细胞分离方法的影响外,可能还会受测序方法的影响。为了验证这一猜想,Schwalie 等分别利用传统scRNA - seq和10×Genomics单细胞RNA测序两种方法分别对小鼠皮下脂肪组织血管基质部分的脂源性干细胞和前体细胞进行测序分析,结果表明两种测序方法得到的细胞分群结果基本类似,该研究同时以筛选出的标记基因CD142来分选人的脂源性干细胞和前体细胞,得到的细胞分群结果与小鼠一致,不同物种之间细胞分群结果的高度一致性表明了scRNA - seq 技术的稳定性,并强化了已识别的细胞群代表脂肪祖细胞生物学的一般范式的概念。scRNA -seq技术在已知细胞亚群的鉴定和未知细胞类型探索中的应用,为细胞发展、生理学、病理学以及细胞外调控等研究方面带来了新的认知,在生物和临床医学领域发挥重要作用。
 
出自《单细胞转录组测序技术及其在肌内脂肪细胞研究中的应用》作者张久盘,马青,王锦 。