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问:基因表达谱对乳腺癌的分类的应用是怎样的?2021-10-20 10:42:34

答:基因表达谱对乳腺癌的分类具有重要贡献。为了确定类器官是否为肿瘤异质性的真正模型,除了将类器官的基因组谱与肿瘤组织比较,还需要将表达谱与肿瘤组织进行比较。SACHS等通过对22个乳腺癌类器官进行RNA测序,并根据>25000个基因组装相关热图,比较了乳腺癌组织和乳腺癌类器官的基因表达,发现乳腺癌类器官的基因表达谱几乎与原乳腺癌组织的基因表达谱相一致。

前人已提出基于RNA表达的乳腺癌分类系统:PAM50、SCMGENE、SCMOD1 和 IntClust,前3个分类系统主要与受体状态相关,以基底型、管腔型 A 和正常亚型为主导的PAM50,以 ER/HER2 阴性为主导的 SCMGENE 和 HER 阳性亚型为主导的SCMOD1。SACHS 等发现分类系统中几乎所有亚型均可找到相对应的乳腺癌类器官。因此,乳腺癌类器官具有代表性的基因表达谱,可以在不存在明显培养偏差的情况下,分级聚类成大多数基于 RNA 表达的乳腺癌亚型,并有助于上皮细胞生物学现象的表征,进一步强调了它们作为乳腺癌代表模型的潜力。
 
上述研究表明,乳腺癌类器官始终保持着原始组织的组织学、基因组、转录组特征,为人们更好地探究乳腺癌提供了一种非常有前景的新模型。
 
出自《乳腺癌类器官研究进展及临床应用前景》作者焦慧,张一宁,宋雨晴。