问:单细胞测序数据如何分析?2024-12-30 09:06:28
答:前期研究表明,P0.5生殖细胞scRNA-seq(GEO登记号:GSE124904)数据分析发现的2个细胞分群与精原前体细胞2种细胞命运的生物学特征相吻合。为研究Rb1-cKOVasa雄鼠SSCs未形成的原因,下载P0.5生殖细胞scRNA-seq数据进行重新分析。在分辨率设定为0.1时拟合了类似于前期证实的2个细胞群落。数据在R(4.1.2)中利用Seurat软件包(5.0.3)进行降维、标记基因和差异基因分析。差异基因GeneOntology(GO)分析通过DAVID Bioinformatics Resources 6.8进行。出自《静息期精原前体细胞Rb1基因敲除致精原干细胞特化异常机制研究》作者:陈新玲,龙旖璇,杜桂花.
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