在分布方面，蛋白质药物难以广泛渗透组织，主要依靠对流和内吞作用的跨细胞迁移从血管空间向组织间质空间转运。蛋白质药物的分子大小与分子量、理化特性（如电荷、亲脂性）、与内源性蛋白以及特异性受体的结合能力，均会影响其组织分布。蛋白质药物的代谢主要通过体内蛋白酶将其水解为氨基酸和小肽，这些氨基酸会被重新投入于内源性氨基酸池，用于人体内结构或功能蛋白质的从头生物合成。这种代谢方式与传统的肝脏代谢途径有着本质区别。
 

蛋白质药物的消除途径较为复杂：分子量在1000~50000 Da的蛋白质主要通过肾脏滤过清除，分子量＞50000 Da的蛋白质因超过肾小球滤过屏障的截留阈值，肾脏清除贡献显著降低，此时主要通过受体介导的内吞或吞噬作用消除。此外，新生儿Fc受体通过胞吞回收机制使IgG类蛋白质药物免于溶酶体降解，从而延长其半衰期。免疫原性也是影响蛋白质药物药动学的重要因素，因为抗药抗体可能加速药物清除。同时，靶点介导的药物处置可使蛋白质药物表现出非线性药动学特征，即在靶点未饱和时具有较高的清除率，而在靶点饱和后趋于线性。
 

出自《化学修饰内源性物质的成药性研究》作者：袁涛, 肖苏龙, 周德敏。