微生物可通过直接调控上皮细胞营养转运机制影响宿主营养吸收效率。Wang等研究表明，解淀粉芽孢杆菌与仔猪回肠类器官共培养时，可促进Lgr5+干细胞向杯状细胞分化，并抑制其向吸收性肠细胞分化，使类器官凋亡率降低40％；同时上调芳香烃受体靶基因Cytochrome P450 Family 1 Subfamily A Member 1（CYP1A1）表达，从而增强肠道黏液屏障功能并减少营养流失。Ding等发现揭示罗伊氏乳杆菌预处理可使LPS损伤后的肉鸡肠类器官出芽率提高2.1倍，促进β-catenin核转位并上调Wnt3信号通路相关基因表达，使氨基酸吸收效率提升15％。
 

另一方面，类器官在揭示微生物代谢物直接生物活性方面具有突出价值。膳食纤维的发酵产物短链脂肪酸在这一调控网络中发挥核心作用。Danica等利用小鼠肠道类器官证明，梭菌可通过产生丙酸促进上皮再生。Inoue等进一步发现，丙酸盐作为膳食纤维发酵的关键代谢物，可通过人肠道类器官受体直接调节肠细胞能量代谢。
 

出自《肠道类器官的构建及其在食品营养方法学中的应用》作者刘畅，张雪纯 ，李涵。