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TCR与BCR测序追踪免疫克隆谱系2026-07-28 08:58:31

由于mRNA水平并不总是能够准确反映蛋白质丰度及功能活性,单纯依赖转录组数据可能低估蛋白质水平调控在细胞命运决定中的作用。早期Bendall等人利用单细胞质谱流式技术对健康人骨髓细胞进行高维蛋白检测,在单细胞水平描绘了人类造血连续分化过程中不同细胞亚群的免疫表型和信号响应特征,为利用蛋白水平信息解析造血层级和细胞状态转换提供了重要基础。在此基础上,Palii等人结合单细胞质谱流式与绝对定量质谱法,系统分析人类红系分化过程中谱系特异性转录因子蛋白的动态变化。

该研究发现,早期HPCs中不同谱系相关转录因子可在蛋白水平共表达,而细胞命运转变并非仅由某一转录因子的表达决定,而是与谱系特异性转录因子蛋白丰度的渐进性定量变化密切相关。这一发现说明,SCP能够揭示转录组分析难以捕捉的蛋白剂量效应及其在早期造血命运决定中的作用。近年来,基于质谱的SCP进一步被应用于人类造血干/祖细胞分化研究。Furtwängler等人利用单细胞质谱蛋白质组学构建了CD34+人骨髓造血干/祖细胞的单细胞蛋白质组数据集。
 
该研究显示,单细胞蛋白质组数据能够重建早期人类造血分化层级,并识别出一部分与干细胞静息和功能维持相关但在mRNA水平并不显著的关键蛋白;同时,部分功能性蛋白共变关系仅能在蛋白水平被检测到,而难以从转录组数据中推断。这些结果提示,SCP不仅是单细胞转录组学的补充,更可从功能执行层面揭示造血细胞的异质性、静息维持及早期分化过程中的关键调控事件。单细胞技术在免疫学中的广泛应用,同样深化了我们对细胞间相互作用及免疫细胞功能多样性的认知。该技术通过特异性引物扩增T细胞受体或B细胞受体基因的可变区序列,从而以单细胞分辨率解码TCR与BCR,精确追踪免疫细胞的克隆性和多样性,为解析适应性免疫的关键机制提供了前所未有的视角。
 
出自《单细胞多组学技术在造血干细胞研究中的应用与进展》作者张奕扬,董芳。