骨髓微环境具有显著空间异质性，不同HSCs可分布于骨内膜、窦状血管、动脉血管或脂肪细胞周围等不同区域，并接受差异化的局部信号刺激。因此，空间组学不仅能够揭示骨髓中不同细胞类型的组成，还能够进一步分析特定HSCs细胞群位于何处、与哪些细胞相邻、处于何种局部信号环境之中，从而为理解HSCs命运调控提供更接近组织真实状态的信息。Baccin等人联合单细胞转录组与空间转录组技术，系统绘制了小鼠骨髓中骨内膜、窦状血管和动脉血管等不同微环境的细胞组成及空间分布图谱。
 

该研究揭示了CXCL12丰富的网状细胞、内皮细胞及其他基质细胞在不同骨髓微环境中的定位特征，并通过整合单细胞表达谱和空间定位信息，解析了骨髓微环境的分子组成和空间组织。在此基础上，Xiao等人利用空间转录组技术对小鼠骨髓信号进行了进一步研究，发现骨髓内不同空间区域呈现差异化的信号通路活性，并识别出与骨髓间质和造血调控相关的空间特异性信号区域。这些研究表明，空间组学能够从组织结构层面补充传统单细胞测序结果，为解析HSCs与骨髓微环境之间的调控关系提供重要依据。
 

出自《单细胞多组学技术在造血干细胞研究中的应用与进展》作者张奕扬，董芳。