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复制压力下HSCs表观遗传响应2026-07-31 08:43:17

将数据进行联合分析,有助于更系统地重建HSCs分化轨迹、识别关键调控网络,并揭示正常造血、衰老和血液系统疾病发生过程中的多层级调控机制。多组学源于单组学技术,且保留了核心的步骤,如细胞的分离与收集和一些标记策略等,并随后进行测序,在数据处理后进行整合。例如Chen等人在研究范可尼贫血这一遗传性骨髓衰竭综合征时,通过整合scRNA-seq与scATAC-seq等多组学技术系统阐明了FA中HSCs功能缺陷的表观遗传学新机制,并绘制了复制压力下HSCs的响应图谱。

该研究发现HSCs在复制压力下适应性出现H3K27ac修饰及染色质可及性增加现象,而限制染色质的松弛会阻碍复制压力的消减,进而损害HSCs的维持及造血功能,揭示了“Fancd2缺陷 → p38/ATF2信号激活 → DEK转录上调 → 染色质压缩 → 复制应激→ HSCs功能衰竭”的调控轴,不仅为解释FA中HSCs功能缺陷提供了新见解,也为FA的治疗提供了潜在的干预方向。而在血液系统肿瘤研究中,近期Tian团队整合了线粒体单细胞染色质可及性测序、scRNA-seq技术及mtDNA突变信息,对AML患者的骨髓细胞进行了系统解析。
 
该研究首先建立了高分辨率正常人造血干/祖细胞多组学参考图谱,揭示了从HSCs向各谱系分化过程中染色质可及性与基因表达的动态演变规律,并通过将AML肿瘤细胞投射至这一正常发育轨迹,实现了肿瘤细胞发育阶段的鉴定,并识别出其分化阻滞的关键节点。值得注意的是,该研究发现在形态学上已呈现分化特征的AML细胞中仍存在明显的早期造血阶段特异的染色质可及性特征,提示AML细胞的形态学分化状态与染色质调控状态之间存在不一致。
 
出自《单细胞多组学技术在造血干细胞研究中的应用与进展》作者张奕扬,董芳。