马赛克蛋白疫苗是利用一个同源蛋白质库经过多轮重组比对获得的重组蛋白，其与天然蛋白非常相似，但对9-12个氨基酸的短肽有最大的覆盖率，因此排除了非天然和稀有“k-mers”，是目的蛋白最有代表性的变异体，以其制备的疫苗对异源毒株具有更好的交叉保护效果。洛斯阿拉莫斯国家实验室的艾滋病病毒序列数据库小组开发了基于 web 的马赛克蛋白疫苗设计工具，用于设计和评估马赛克蛋白的潜在的表位覆盖率。目前该技术已用于艾滋病病毒、猪繁殖与呼吸障碍综合症病毒等马赛克疫苗的开发，动物试验表明对异源毒株具有交叉保护作用。
 

诱骗表位是一种免疫优势表位，能够有效刺激B细胞产生特异性抗体，但因其产生的并不是中和抗体，从而使病毒行使免疫诱骗，借此逃逸宿主体的免疫攻击。PCV2 Cap蛋白上 169-180 位氨基酸残基组成的肽段是PCV2病毒的诱骗表位，且在不同PCV2亚型毒株中高度保守，其中的 173-Tyr，174-Phe，175-Glu是抗体结合的关键氨基酸。Yu等研究表明，诱骗表位位于 Cap蛋白单体的表面，是Cap蛋白上具有免疫优势的表位。Cap蛋白单体正常情况下会自发组装，由60个单体组成的病毒样颗粒结构，其诱骗表位在形成VLPs过程中被压在 60 聚体的内部，并不位于VLPs的表面。
 

因此PCV2做成疫苗免疫动物后产生诱骗抗体的水平很低。PCV2疫苗若保存不当等，VLPs会解聚成Cap蛋白单体，诱骗表位会暴露出来造成免疫动物产生大量的诱骗抗体，造成免疫失败。因此，将Cap蛋白上诱骗表位替换成可促进细胞免疫的多肽来增加PCV2疫苗的免疫效果，不失为一个明智的选择。
 

出自《猪圆环病毒2型新型疫苗的研制及中和抗体快速检测方法的建立》作者侯竹美