单细胞测序显示单个细胞水平的基因表达2022-08-17 08:47:07
前期临床研究发现相同条件下体外培养的AF-MSC细胞表面标志物符合MSC要求，且传代后的细胞形态、染色体核型无明显改变。本研究对AF-MSC进行scＲNA-seq，每个细胞检测基因中位数为5 971个基因，与文献报道的MSC的scＲNA-seq结果相一致。对单个细胞中基因数进行统计结果显示，部分细胞基因表达数在2500个左右存在一个小的峰值，进一步对基因数为200～3000的细胞进行分析，结果显示细胞聚类为 7个亚群，且主要在亚群3（44％） 和亚群4（48％）中，结合后续分析结果，考虑亚群3可能为初步分化的细胞，亚群4类型暂无法确定。本研究证实细胞周期对聚类分群产生了影响:不同周期细胞在亚群的分布情况及GO通路富集结果显示，细胞周期对于亚群的影响较大，该结果与Huang等、Sun等的研究结果相似。同时我们对AF-MSC表面标志物的表达情况进行了分析，结果与既往研究结果相似。对于细胞表面标志物VCAM1，在DiTrapani等和Cananzi等的研究结果中有差异，而在我们的结果中显示在少量细胞阳性表达，提示单细胞测序可显示单个细胞水平的基因表达，可对基因表达情况进行更精确的判定。
综上所述，本实验结果与利用流式细胞术对AF-MSC的研究结果相吻合;且通过scＲNA-seq对AF-MSC可以进行更细致的分群，为后续进一步研究AF-MSC的特征提供了研究基础。但本研究也有一定的局限性，由于纳入样本较少，且未进行后续实验验证，发现的结果仅具有一定的提示性，需要扩大样本量进一步验证。
出自《基于单细胞ＲNA测序的人羊水间充质干细胞异质性分析》作者郑玉婷，朱晓帆，杨宇霞。
