单细胞多组学的测序分析2021-09-24 09:59:41
多组学时代,存在许多研究基因组、转录组、蛋白质组和表观遗传修饰的方法。最初, 组学的研究是对于多细胞或复杂组织的探究,从而产生平均效应, 这种效应可能会掩盖多层数据之间的直接相关性。但在单细胞水平上进行多组学分析就可以消除这种平均效应。多组学分析有助于我们从不同分子水平对同一生命现象进行验证和探索, 探讨各细胞基因组、转录组、蛋白质组和表观遗传之间的关系。除此之外, 单细胞多组学分析降低了技术噪音和生物噪音对单一组学数据获取的影响, 增加了数据分析的可靠性。近几年, 单细胞多组学测序分析技术也已经被应用到生殖研究领域。2017年,北京大学汤富酬团队开发了一种单细胞表观多组学测序技术时分析单细胞的染色质状态, 染色体倍性, 核小体定位、DNA甲基化、拷贝数变异, 并利用该技术解析了植入前小鼠胚胎发育过程中染色质状态和DNA甲基化的动态变化。对scCOOL-seq技术进行了改进, 开发了iscCOOL-seq技术, 揭示了小鼠卵母细胞生长过程中的表观遗传改变和全能性的建立。
联合单细胞转录组和甲基化测序, 分析诱导多能干细胞, 结果表明, 基于基因组特征和DNA甲基化信息可以准确预测外显子的不同剪接模式。生殖细胞和胚胎细胞的多组学分析, 有助于我们深入探索表观遗传调控和染色质动态变化在细胞全能性维持和细胞发育中的重要意义。基于测序技术和质谱技术的单细胞多组学分析, 将为我们揭开更多的生殖奥秘, 解决更多的生殖难题。
出自《单细胞测序技术在生殖研究中的应用》作者高山凤,肖轩,张玲羽。
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