scRNA-seq可以检测不同生殖阶段的群体细胞,通过伪时间分析确定生长周期中不同细胞的发展顺序.然而,也有一些基因是独立于细胞周期而变化的,它们主要存在于亚端粒区域.Reid等建立了一种适用于疟原虫 scRNA-seq的新方法,不仅可以区分不同的细胞类群,还可以探索细胞与细胞之间潜在的功能差异,揭示了在传播阶段的不同性别差异表达的基因家族,它们通常是与逃避宿主免疫和发病机制相关的.
 

在恶性疟原虫中,var基因家族是通过细胞黏附和抗原变异建立慢性感染的关键,在雄性中没有发现明显变异,而在雌性中表现出转录变异.在无性寄生虫中,2 种不同的非编码 var 转录本的表达是常见的,并参与维持相互排斥的var 基因表达,这对它们的免疫逃避作用至关重要.因此,scRNA-seq 还可以为基因家族中互斥表达基因成员之间的相关转录事件提供新见解,如巴贝斯尼亚牛的 ves 基因家族和蓝氏贾第鞭毛虫的vs p 基因家族等.
 

出自《单细胞测序及其在寄生虫学研究中的应用》作者朱婷, 耿铭,李庆伟