基因在宿主免疫应答方面的应用2021-09-29 09:47:34
先前研究的是宿主的群体细胞对寄生虫的免疫应答,而通过 scRNA-seq 还能够揭示宿主免疫细胞应答时的群体细胞差异性。并进一步探究其免疫应答时的分子机制.细胞内寄生虫通过控制宿主细胞的免疫机制以启动和维持感染.传统批量获得的转录组学数据掩盖了寄生虫和宿主细胞之间相互作用的异质性,这些相互作用取决于宿主对感染反应的应答、宿主细胞类型、感染类型、组织组成等.Fontana等发现了在CD4阳性T细胞中,编码巨噬细胞刺激因子（MCSF）的基因Csfl在一类T细胞亚群中高表达;感染过程中CD4阳性T细胞Csfl的选择性缺失,降低了某些骨髓亚群增殖和活化的能力.其中,最显著的是淋巴结CD169阳性巨噬细胞,从而导致感染寄生虫的小鼠恢复受损.感染过程中 CD1 69阳性巨噬细胞的减少也导致寄生虫噬血症增加和宿主死亡率升高.总的来说,在单个细胞水平上捕获病原体和宿主转录本的动态变化对于探究不同感染状态之间的关系非常重要.
最近的研究成功证实scRNA-seq能够同时捕获病毒或细菌与宿主的转录本.虽然宿主-细菌双测序需要捕获非聚腺苷酸转录本,但细胞内寄生虫感染宿主-病原体 scRNA-seq 联合应用是可行的,而且几乎没有技术障碍.Swierzy 等通过单细胞高通量测序,绘制了受弓形虫菌株感染前后的小鼠细胞表达谱,通过对小鼠皮层神经元、星形胶质细胞、骨骼肌细胞和成纤维细胞等差异表达基因分析鉴定,发现弓形虫与其宿主不同类型的细胞之间存在特异性反应.因此推测,不同宿主类型的细胞的异质表达以及寄生虫对它们的适应能力可能干预着寄生虫-宿主的相互作用.
出自《单细胞测序及其在寄生虫学研究中的应用》作者朱婷, 耿铭,李庆伟
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