利用CRISPR/Cas9系统，不仅可以进行基因突变，也可以借助带有左右同源臂的供体，将外源片段引入基因组或敲除特定片段，实现基因的精准编辑。但突变体的筛选除了利用敲入的标记基因外，绝大多数依靠提取基因组、PCR甚至测序，且不同基因可能由于所处染色质位置不同，或者对发育的作用不同，突变效率差异很大，对于这些基因，筛选其突变体成本高，且耗时费力。因此如何便捷快速筛选所需突变体仍然是该系统亟需解决的问题，这也是这套系统应用以来还没有建立其大规模突变资源库的原因。在研究基因在组织器官的功能时，也有一些实验室利用Gal4/UAS系统，条件性控制Cas9的表达，在sgRNA的作用下产生突变，但是这套系统仍有较大的局限性，比如在组织器官中产生突变的细胞数量少，检测确认困难，且由于突变细胞的随机性产生了表型的多样性，分析困难，所以条件性突变系统应用范围较小。
 

RNA干扰是指细胞中的单链或双链RNA，将与其互补的内源性mRNA降解，从而导致基因表达沉默的现象。模式动物果蝇中主要有两个RNAi通路，小干扰RNA通路和微小RNA通路。具体来说：siRNA通路，某些转录产物、病毒入侵产生的RNA以及人工DNA载体转录的RNA，可以形成长双链RNA，经过Dicer2切割，产生21~23bp的siRNA，其中一条RNA链整合到含有Ago2的RNA沉默复合体中，通过碱基配对找寻目的mRNA，结合并将其降解；（2） miRNA通路，内源或人工DNA载体转录出带茎环结构的pri-miRNA，经过核酶Drosha切割去除首末端，产生的pre-miRNA随后出核被Dicer1加工，形成22~24 nt的miRNA，其中一条RNA链可以整合到含有Ago1的沉默复合体里，如果其序列与mRNA3端UTR结合可以抑制该基因的翻译；如果其序列与mRNA的可编码序列高度匹配，则同siRNA通路类似，可以将mRNA降解。
 

出自《模式动物果蝇的基因调控前沿技术》作者韩玉婷，许博文，李羽童.