对于有特定基因序列的细胞，如嵌合抗原受体T细胞，可以根据特异性的基因序列设计引物序列。Schubert等在急性肾损伤小鼠静脉输注后第 3、6天，通过生物发光技术显示 MSCs 被清除。然而，当在第6天对几个组织进行从qRT-PCR检测时，在血液、肝脏、肾脏和肺中检测到不同数量mRNA。因此，qRT-PCR似乎是更灵敏的方法，可能是检测组织中晚期MSCs存在的更好选择，并可用于补充成像技术。
 

组织学方法包括传统的免疫组织化学、免疫荧光以及原位杂交等。免疫组织化学和免疫荧光是传统的检测方法。原位杂交方法是基于DNA 或DNA/RNA双链互补的大分子识别技术，与荧光团偶联的核苷酸整合的DNA链可以用作探针以杂交到追踪细胞的互补序列上，然后通过荧光显微镜或成像系统进行观测。该技术能够高灵敏度和特异性识别目标DNA或RNA序列，并且实现在单细胞水平杂交信号的可视化。但是在应用较短的cDNA探针时，荧光原位杂交技术不能保证 100％杂交。RNAscope是新型的RNA原位杂交技术，该法克服了以前的RNA原位杂交技术的弱点，如灵敏度低、非特异性杂交、对样本要求高等，可替代传统的FISH原位检测的方法，灵敏度更高。荣斌等使用RNAscope检测到CAR-T在输注14 d后少量特异性分布于骨髓和脾脏。组织学和qRT-PCR 技术均是在离体组织上进行的，相比于成像技术，它们不能直接获得细胞在体内的分布情况。
 

出自《细胞治疗产品示踪技术研究进展》作者郝晓芳,耿兴超,黄瑛.