154个circRNA在所有阶段均表达2023-08-08 08:56:47
作为女性的特有器官——卵巢,它具有生殖与内分泌功能,而卵泡为具有这一功能的细胞。Pan等首先通过高通量测序在青春期母猪卵巢中测出了972个circRNA,其中154个circRNA在所有阶段均表达,研究者们发现“circ9:131264261-131268491”可能与卵泡发生或激素相关的基因(如FSTL4、GAS2)之间存在相互作用。在卵巢中唯一表达的8个circRNAs的亲本基因可能调控卵巢的生长发育,如“circ10:22806071-22812591”亲本基因为NR5A2;circ6:161225244-161281707亲本基因为FAF1;“circ6:158955138-158958815”亲本基因为LRP8。除此之外他们还发现,AS(non-canonicalalternativesplicing,非典型替代剪接)的方式对青春期卵巢中circRNA的生成起着重要的作用。同年,Li等为了探索circRNA的潜在功能,将舌鳎卵巢样本根据发育阶段分为三组,并且根据分类分别对脑、垂体、肝脏及卵巢4个部位收集样本并进行测序。研究者们通过对比不同组织中不同时期比较组衍生的基因库,制作了一组circRNA差异表达的热图,发现circRNA 组织及发育阶段均存在差异表达。为了进一步了解circRNA的基因生物学功能与分子间的相互作用,研究者们进一步对circRNA通过基因功能国际标准分类体系及基因组百科全书信号通路进行分析,在差异分析中,发现52个官能团及 170个信号通路富集显著。
出自《circRNA与卵泡发育相关研究进展》作者彭婧,李晓云,石城。
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