甲状腺内不同类型免疫浸润细胞比例的计算2021-11-03 08:56:58
从TCGA数据中获取得到的DTC及正常甲状腺转录本中提取mＲNA表达谱数据，通过CIBEＲSOＲT软件进行反卷积法，此算法通过在 1 000 个排列中使用 LM22（ LM22 为白细胞基因矩阵） 进行，从而得到每种类型免疫细胞在甲状腺组织中的浸润丰度，其中幼稚 T 细胞（ 浸润为0，最后得到 21 种免疫细胞浸润相对丰度［免疫细胞包括: 幼稚B细胞 、记忆性B细胞 、浆细胞、CD8 + T细胞（ CD8 + T cells） 、未活化的CD4 + T细胞 、活化的CD4 + T细胞 、滤泡辅助性T细胞、调节性T细胞 、γδT 细胞、未活化的自然杀伤细胞、活化的自然杀伤细胞、单核细胞、M0巨噬细胞、M1巨噬细胞 、M2巨噬细胞、静息态树突状细胞、活化树突状细胞、未活化的肥大细胞、活化的肥大细胞、嗜酸性粒细胞、中性粒细胞。每一例样本所有免疫细胞之和为100％ 。通过对正常甲状腺组织与DTC组织中的浸润免疫细胞情况进行分析，免疫细胞在DTC的浸润情况与在正常甲状腺组织中的浸润情况存在明显差异，在 DTC 微环境中M0 巨噬细胞、M2 巨噬细胞、静息态树突状细胞及未活化的肥大细胞的浸润相对丰度高于正常甲状腺组织中上述免疫细胞的浸润相对丰度（ P ＜ 0． 001） ; 而幼稚 B 细胞及 CD8 + T细胞在DTC微环境中的浸润相对丰度则低于正常甲状腺组织中的浸润相对丰度（ P ＜ 0． 001） ，另外，将 DTC微环境中各浸润免疫细胞间关系进行相关性分析，可得出 M0 巨噬细胞分别与滤泡辅助性 T 细胞（ r = －0．52） 、浆细胞（ r = － 0． 55） 、CD8 + T 细胞（ r = － 0． 59）呈负相关; 而 CD8 + T 细胞与浆细胞呈正相关（ r = 0． 52） 。
出自《分化型甲状腺癌组织中浸润免疫细胞的类型及其与临床特征的关系》作者徐佩，关海霞。
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