转录组是维持细胞身份的重要组成部分2024-04-11 09:46:28
中医药防治骨质疏松症有其特色之处，中药复方成分复杂、作用靶点众多，识别具体作用机制困难，单细胞转录组能够识别特定的细胞亚群、鉴定疾病相关核心靶点，两者结合可以从细胞层面理解中药复方的作用机制。有研究利用液质联用技术和单细胞转录组分析研究参苓白术散的作用机制，发现参苓白术散通过调控免疫细胞与骨细胞的相互作用防治骨质疏松症。将单细胞组学技术体系纳入中医药研究的框架，建立相应基于单细胞组学技术的中医药现代性研究策略，将研究尺度从宏观投射到微观细胞层面，可以将复杂中药成分作用于单细胞亚群，探究其对亚群转录组的影响，进而发掘潜在的中医药价值。鉴于细胞RNA作为信使，形成调节及管理细胞功能的主要执行者——蛋白，转录组是维持细胞身份和任何生物体生存的重要组成部分。因此，全基因转录组分析解决了几十年尚未解答的问题。但是每种技术都不是完美的，具有其自身的局限性。所有单细胞测序方法主要限制之一可能均是基于DNA。首先，目前的技术水平无法直接从单细胞中测序RNA，意味着必须将RNA反转录成cDNA并进行扩增，这就带来3个挑战：一方面如何减少反转录过程中RNA的损失；另一方面，提供足够的DNA用于测序的同时排除基因组DNA对cDNA的影响。
对于单细胞分离方面，单一的阳性选择方案并不理想，因为分离的细胞由多种类型的细胞组成，如果主要目的是分离纯度较高的细胞则应考虑使用正选择和负选择相结合的方式，但是细胞数量上不足问题也凸显。由于高度矿化的组织中含有低数量的细胞，所以从骨组织获得高质量细胞的技术难度很高。最后，对于样品选择的问题也影响实验的结果，通过分析检索所得文献，单纯的骨质疏症实验样品很难获得，多合并骨骼其他疾病（关节炎），势必会影响实验分析结果。另外，模式生物的应用可以提供更为广泛深入的尝试。
出自《单细胞转录组测序技术在骨质疏松症研究中的应用与进展》作者孙成涛，孙广江,戚晓
