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scRNA-seq是研究复杂组织中细胞异质性的有力手段2024-04-11 09:49:39

在未来需要不断完善scRNA-seq,并需要与其他技术结合,例如空间转录组、单细胞多组学,谱系追踪、活体成像技术等。近年来,空间转录组学迅速发展,可以弥补单细胞转录组缺失空间信息这一劣势,二者结合更加还原组织原貌,且空间转录组不需要分离细胞,直接使用完整的组织切片进行分析,更有利于探究矿化的骨组织;还可以与单细胞组学(基因组、表观组和蛋白组)进行整合,并得到一个关于单细胞的综合理解;上述技术的结合均可以促使骨质疏症领域重新审视骨组织细胞分类学,围绕骨组织细胞的形成、寿命和归宿问题展开更大范围的研究,为进一步开发潜在诊断生物标志物和治疗措施提供新机遇和活力。

scRNA-seq是近年来兴起的一种研究复杂组织中细胞异质性的有力手段。ScRNA-seq以单细胞分辨率测量许多细胞的转录谱,可以聚类以区分和分类细胞亚型,推断发育轨迹,并识别新的调控机制。已被广泛应用于肿瘤、干细胞、心脏及呼吸系统等疾病领域。近些年这项技术应用也延伸至骨代谢领域,尤其是骨质疏松症方向。目前的单细胞测序技术已经揭示了大部分骨髓微环境中非造血细胞的异质性和粗略的差异层次,揭示了骨髓微环境中,骨髓间充质干细胞三系分化(软骨细胞、成骨细胞和脂肪细胞 )在时间和空间上位于不同的区域,且随着年龄增加等因素,骨髓间充质干细胞衰老导致新旧细胞更替潜能下降,与退行性疾病(骨质疏松症) 有因果关系,为后续的骨代谢研究提供了新理念、新方法和新技术。
 
值得关注的是scRNA-seq只能提供不同细胞亚群的近似值,尚且不能严格显示与骨髓内其他成分的相互作用,另一方面,目前的scRNA-seq技术不能提供亚群的空间定位。有必要开发高维度整合分析和空间转录组学分析的方法,这有助于更全面了解骨髓微环境中复杂的细胞相互作用和动态变化。
 
出自《单细胞转录组测序技术在骨质疏松症研究中的应用与进展》作者孙成涛,孙广江,戚晓楠.