微生物对细菌等微生物的测序存在一定的局限性2024-04-12 11:20:16
近年来，随着单细胞测序技术的发展，其在微生物领域的应用也日益普遍。Ｃｒｏｓｓ等应用单细胞测序和反向基因组学的方法培养了人口腔 Ｓａｃｃｈａｒｉｂａｃｔｅｒｉａ菌门的三个不同菌种，发现其均为放线菌的体表寄生物种，并且利用相同的方法，分离并培养出了一种先前无法培养的人口腔细菌 ＳＲ１。Ｃａｍｐｂｅｌｌ等通过单细胞基因组学测序首次从牙周炎患者口内分离出绿湾菌。 Ｂｅａｌｌ等通过单细胞测序发现了与福赛坦纳菌亲缘关系相近的坦纳菌ＢＵ０６３和坦纳菌ＢＵ０４５，其中坦纳菌ＢＵ０６３主要存在于健康牙周组织中，而坦纳菌ＢＵ０４５则和牙周炎的发展密切相关，为慢性牙周炎发病机制提供了新依据。口腔脱硫菌作为一种新的牙周致病菌，属于难以分离培养的口腔微生物，传统方法是通过硫酸盐还原生理学的原理，在纯培养中富集并随后分离而得，而Ｃｒｏｓｓ等根据单细胞基因组数据分析微生物的生理特性分离出了口腔脱硫菌，并发现口腔脱硫菌主要依赖梭杆菌产生的营养物质生长，其毒性及促炎特性也是由其他的口腔微生物转移获得。
由于微生物的体积较小、存在细胞壁且ｍＲＮＡ缺乏ｐｏｌｙＡ尾等因素，使得对细菌等微生物的测序存在一定的局限性。 目前，针对原核细胞ＲＮＡ的测序方法包括Ｓｐｌｉｔ⁃ｐｏｏｌ和ＢａｃＤｒｏｐ等，分别刊登在Ｓｃｉｅｎｃｅ和Ｃｅｌｌ上。随着微生物单细胞测序的更新及应用，细菌群体耐药、细菌与宿主相互作用及微生物时序表达等研究在未来会取得新的突破。 特别在口腔微生物领域，可应用于如单个牙周致病菌与宿主之间的相互作用机制、龋病致病菌的时序表达差异等，进一步揭示口腔微生物的致病机制及其与宿主之间的相互作用关系。虽然目前尚无口腔微生物的空间转录组测序，新的高通量空间转录组成像方法已能观察铜绿假单胞菌生物膜在微尺度上的空间信息。
出自《单细胞测序和空间转录组技术在口腔医学的应用进展》作者张夏桐，吴文治，陈卓.
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