除了对牙髓、牙周膜干细胞进行单细胞分析外，单细胞测序也应用于颌骨骨髓干细胞及其与骨免疫微环境的相关研究。Ｌｉｎ等发现与长骨相比，牙槽骨中的免疫微环境更为活跃，免疫细胞的占比也更高。在牙槽骨的免疫细胞亚群中，单核／巨噬细胞亚群与间充质干细胞亚群的联系最为密切，在长骨中，单核／巨噬细胞更高表达抑瘤素Ｍ以促进ＭＳＣｓ的成骨分化且抑制ＭＳＣｓ的成脂分化。目前，单细胞测序技术在口腔间充质干细胞中的应用主要集中在干细胞亚群的区分及生物信息分析，值得注意的是，在疾病微环境下，干细胞的异质性是否会发生变化，干细胞与其他细胞之间的通信是否会受到影响，尚需要进一步的研究。
 

口腔微生物群是仅次于肠道微生物群的第二复杂的人体微生物群落，包含７００种细菌，也包括真菌、病毒等。口腔微生物群与宿主的口腔健康及全身健康或疾病密切相关。研究表明口腔微生物与龋齿、牙周病、口臭等口腔问题关系密切，同样也和心血管疾病、糖尿病等全身系统性疾病的发生发展有关。传统的口腔微生物测序方法主要是以１６Ｓ核糖体核糖核酸基因特征区域测序和宏基因组测序为主，但是其提供的生物学信息有限，尚难以对不易培养的微生物进行测序。
 

出自《单细胞测序和空间转录组技术在口腔医学的应用进展》作者张夏桐，吴文治，陈卓.