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问:单细胞测序技术的概述是怎样的呢?2021-09-24 11:25:44

答:单细胞测序是通过分离单细胞、构建文库和测序分析描绘单细胞图谱,从单细胞水平揭示细胞基因组、转录组及表观遗传变化的技术。与既往的组织测序不同,单细胞测序是先把组织或体液中的细胞群分离至单个细胞水平,然后将提取的核酸(DNA或RNA)扩增至最低检测水平,进行基因组和转录组的测序,或者直接对单个细胞进行表观遗传学测序。目前单细胞测序技术主要包括单细胞的基因组测序、转录组测序和表观遗传测序。

单细胞基因组测序
单细胞基因组测序是将分离得到的单细胞进行DNA提取.随后对DNA进行全基因组扩增和测序分析。主要用于检测单核苷酸突变、拷贝数变异及染色体结构变异。
 
单细胞转录组测序
单细胞转录组测序是在分离出单细胞进行RNA提取后,先将捕获的mRNA反转录为cDNA,再进行全转录组扩增和测序分析。转录组测序直观地反应了基因表达情况,能更好地揭示细胞种类、亚型、状态和发展轨迹阴。
 
单细胞表观遗传测序
除了基因组遗传信息外,表观遗传性学信息对基因表达同样有着重要调控作用,例如正常的甲基化修饰可以调控细胞的生长、代谢,而异常的DNA甲基化则会诱发肿瘤。单细胞水平的表观遗传学测序对了解生物生长发育以及疾病的治疗有很大帮助。
 
单细胞多组学测序
多组学同步测序分析有助于进一步探讨基因组、转录组和表观遗传学三者之间的复杂关系,包括转录组与基因组、表观组和蛋白组的整合。

出自《单细胞测序技术在消化系统肿瘤研究中的应用及进展》作者张路遥.时永全。