Lgr5+ISCs增殖分化维持肠道组织更新。肠道上皮细胞、间充质细胞、免疫细胞和微生物等产生的调控ISCs更新、增殖和分化的信号分子组成的微环境被称为干细胞生态位，主要包括Notch、Wnt、骨形态发生蛋白和表皮细胞生长因子等信号分子。干细胞之间会竞争肠道生态位，被“挤出“干细胞区的细胞在接触到不同浓度的分化调控因子时进行分化。具体而言，当Lgr5+ISCs细胞受到Notch信号通路效应分子hes家族bHLH转录因子1的刺激后，ISCs先转化为过渡放大细胞后进而分化为肠细胞。
 

当细胞未受到Notch信号通路的刺激时会分化成分泌型肠上皮细胞祖细胞。迁移离开干细胞区的分泌型祖细胞在接受到Wnt信号刺激后会在上皮细胞之间的Eph-ephrin作用下返回隐窝底部成为潘氏细胞。未受到Wnt蛋白刺激的分泌型祖细胞分化成为杯状细胞、肠内分泌细胞或Tuft细胞。M细胞的分化不受Notch和Wnt通路的影响，主要是由派尔集合淋巴结中核因子受体激活因子-κB配体直接刺激形成。Notch信号通路是决定Lgr5+ISCs分化命运的关键信号通路。Notch信号的激活依赖配体呈递细胞和受体细胞之间的直接接触。因此，Notch配体如Dll1和Dll4主要由与ISCs相邻的间充质细胞和潘氏细胞提供。Notch配体和受体之间的相互作用会诱导受体细胞内形成Notch胞内结构域。
 

出自《肠道微生物和宿主肠道干细胞互作机制的研究进展》作者郭芳申，甄文瑞，张祎。