IBDV毒株的多样和复杂性2022-02-11 09:13:13
通过比较vVP2基因毒力相关氨基酸位点，29株分离株中有27株分离株具有vvIBDV的特征，表明2012-2015年间广西IBDV流行毒株以vvIBDV为主。基于VP1b基因氨基酸位点，29株分离株中有24株分离株同时具有vvIBDV的特征和弱毒株的特征。系统进化树的分析结果进一步表明 IBDV基因组A节段和 B节段之间不同的进化关系。基于vVP2、VP1b基因系统进化树，29株分离株可以分为4个基因型：vv-A/Att-B、vv-A/Uniq-B、Classical-A/Uniq-B 和Att-A/Uniq-B。其中以vv-A/Uniq-B占多数为 75.9％，其次为 vv-A/Att-B 占17.2％。Uniq-B 分支包括4个参考毒株HLJ0504、Gx、Harbin-1和 02015.1，这4个参考毒株的基因型均为vv-A/Uniq-B。这一类型的毒株也被称作 HLJ0504-like。课题组前期在 2000-2012 年对中国南方 IBDV 分子流行病学的研究中，vv-A/Uniq-B基因型的毒株占仅占19.8％。本研究中，2012-2015年间 vv-A/Uniq-B基因型毒株在广西已成为优势毒株基因型。最近，Hussain等2017年3月在巴基斯坦分离到一株 vv-A/Uniq-B 基因型毒株 PK2。基因突变和基因重组是驱动RNA病毒适应环境的重要分子力量。为了更全面的了解单个基因片段发生基因重组对进化的影响，本研究通过RDP4软件分别对分离株和参考毒株vVP2、VP1b 基因序列进行了重组检测，结果并没有检测到有效重组事件。
此外，本研究对IBDV分离株vVP2、VP1b基因进行了选择压力分析，结果显示vVP2、VP1b基因在进化过程中主要受到负选择。研究表明负选择在 RNA 病毒中比在DNA病毒中具有更强的作用。综上所述，广西IBDV流行株基因组A、B节段具有不同的进化特点，IBDV毒株主要通过基因重排的方式进化。同时，也表明了IBDV毒株的多样和复杂性。因此，为了更好的防控IBD，需要持续跟踪流行毒株的变化情况、选择合适的疫苗以及制定适当的措施进行综合防控。
出自《传染性法氏囊病病毒分子流行病学及新型疫苗的研究》作者陈果。
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