由于肿瘤特异性表达的抗原相对数量较少，当前进入临床的 CAR 或 TCR T 细胞研究几乎均靶向了非突变的自身抗原。自身抗原在所有个体中均表达，扩大了疗法的适用群体，但也因其可能在健康细胞中表达增加了“非肿瘤细胞的靶点结合”的安全性风险。因此，除肿瘤细胞外，TCR 靶向的自身抗原的表达应仅限于人体非必需细胞，或可在治疗期间短暂缺失的细胞。在开展后续研究前有必要对抗原的表达谱进行全面了解。除已发表文献外，通过 IST ／Medisapiens、Genevestigator、BioGPS 等表达数据库进行生物信息学筛选可提供大量的表达信息。由于数据库在数据质量、标准和信息量方面的差异，同时进行多个数据库的检索有助于提供更全面抗原表达谱信息。除表达水平外，表达抗原的器官或组织的功能重要性可能具有更重要意义。

 

另外，RNA 测序、免疫组化数据库等也可作为信息的重要来源。除生理表达情况外，研究者还应同时考虑细胞因子的使用、化疗等治疗手段对靶抗原的表达水平可能产生的影响。TCR 所识别的抗原表位是由 MHCⅠ类分子（由9 ～ 10 个氨基酸构成）和 MHCⅡ类分子（15 ～ 18 个氨基酸构成）所呈递的短线性肽段表位。胞内蛋白质被蛋白酶体或溶酶体降解成肽段后转运至内质网，在内质网内与 MHC 分子相结合进而被转运至细胞表面。肽段中某些氨基酸残基介导肽段与 MHC分子的结合，另一些残基则与 TCR 的 CDR3 相互作用，以提供 T 细胞激活所需的结合位点。因此，除对抗原蛋白的表达谱进行筛选外，还需对靶抗原上的有效表位的肽段进行筛选鉴别。抗原表达谱满足要求并不意味抗原肽段的候选表位具有特异性。对肽段序列进行同源性 BLAST，可进一步排除在其他蛋白上存在同源肽段序列的可能，降低“脱靶”的风险。

出自《TCR T 细胞疗法的研究挑战和审评考虑》作者徐隆昌，韦薇.