若以PGT筛选结果为依据，对此类胚胎予以舍弃，明显违背学术原则。与儿童福利问题有关的PGT问题包括：丢弃或销毁受影响的胚胎（遗传疾病的严重性可能会引发这种担忧）；在无法确定特定突变的X染色体连锁疾病中，使用胚胎性别鉴定会导致正常男性胚胎被排除和破坏以及对引发非医疗原因可能滥用该技术的焦虑。义务论的观点认为，无论出于多么善意，选择后代的特征都是错误的。还有观点认为，人类生殖是一种礼物，任何形式的选择或操纵都会把孩子变成一种产品或商品。欧洲人类生殖与胚胎学学会基于伦理和法律层面起草的人类植入前胚胎的道德状况调查报告指出，胚胎作为未来人类生命的象征，应该受到尊重。
 

PGT在临床应用中也存在诸多难以控制的不确定因素，主要存在两个层面的问题。一是技术层面存在的问题，包括如何安全有效地获得胚胎的遗传物质以供检测，如何克服极低样本量对诊断的准确性以及有效性的影响和如何开发适用范围更广的诊断方法。二是非技术性不确定因素，包括PGT对亲代、子代和社会的影响。
 

出自《分子诊断技术在人类辅助生殖中的应用和发展》作者李雪冰,李永伟。