人体免疫系统的形成与肠道菌群密切相关，肠道菌群在婴儿期就对免疫系统的成熟发挥关键作用，并在整个生命过程中对免疫系统的调节和自身抗原的反应发挥作用。在婴儿期，肠道中有益菌可通过不同途径保护肠道固有屏障，如拟杆菌可促进肠道毛细血管生长，增进杯状细胞分化，刺激黏液产生，进而促进肠黏膜表面保护屏障的形成。研究发现，婴儿期肠道菌群定植的改变可影响肠道相关淋巴组织的发育，进而影响肠道免疫系统的形成。另外，SCHROEDR等研究发现，肠道菌群还具有与远处器官及宿主免疫系统进行通讯的能力。MART魱NEZ等报道指出，遗传、生长环境及人体的激素水平等因素对菌群的差异起到重要作用，导致个体化肠道菌群功能的差异。
 

人体正常条件下的菌群结构相对稳定，可维持肠道功能（吸收肠道内的营养物质，将有害物质排出，避免病原菌的侵害），调节人体能量存储和代谢，刺激机体免疫系统，促进胃肠激素的产生及通过产生神经活性物质调节大脑行为。一旦发生肠道损伤，肠道内环境稳态发生改变，导致肠道菌群紊乱。胃肠道疾病、肝病、神经系统疾病、代谢性疾病和自身免疫病等疾病的发生均与肠道菌群紊乱密切相关。
 

出自《间充质干细胞对肠道损伤及其修复过程中肠道菌群影响的研究进展》作者臧成昊，杨金伟。