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miRNA在IDD中的表达谱2022-11-15 08:53:13

2011年,研究者对IDD中miRNA表达谱进行了首次分析,结果提示相较于脊柱侧凸患者的正常髓核组织,IDD患者有29个差异表达的miRNA,其中6个上调,23个下调。此后10年,多项研究如雨后春笋涌现,继续证实IDD患者的miRNA表达谱异于对照组。Zhao等在2014年比较了IDD和脊髓损伤患者的miRNA表达谱,发现在IDD组有26个miRNA下调,另有25个上调。进一步研究表明,这些异常表达的 miRNA 参与调控包括Wnt、磷酸肌醇3-激酶/蛋白激酶B和丝裂原活化蛋白激酶在内的多种信号通路。

这些信号通路被证实在IDD的发病机制中起着关键作用。另外,互补碱基序列赋予了miRNA结合靶基因3’端非翻译区的能力,使miRNA可通过结合mRNA导致一些与退变高度相关的关键靶蛋白表达减少,从而间接控制IDD的病理过程。随着对非编码RNA研究的进一步深化以及生物信息学分析手段和生物信息学数据库的日趋完善,近年来研究者们针对椎间盘组织构建了更加成熟的非编码RNA与下游分子的互作网络,以期完整地展示椎间盘中miRNA的表达谱。
 
有研究通过Gene Expression Omnibus数据集获得椎间盘中miRNA的相关数据,通过预测数据库,构建了一个与IDD相关的潜在环状RNA-miRNA-mRNA网络,通过维恩分析,研究者鉴定预测出miR-423-5p和miR-185-5p为基质金属蛋白酶-2的上游分子。另有研究通过选择新的高通量测序手段,从IDD的样本和脊髓损伤样本(对照组)中随机抽取3个样本进行非编码RNA测序,结果在IDD中发现了463个差异表达的长非编码RNA、47个差异表达的miRNA和1334个差异表达的mRNA;研究者同样构建了一个竞争性内源性RNA网络,并鉴定了lncRNAXIST-hsa-miR-4775-PLA2G7和lncRNA XIST-hsamiR-424-5p-AMOT/TGFBR3 ceRNA轴;利用实时荧光定量聚合酶链反应对15个IDD样本和15个对照组样本进行上述分子信号轴中差异表达基因的验证,结果发现样本中相关的hsa-miR-4775 与hsa-miR-424-5p确实发生了差异性表达。
 
出自《微RNA在椎间盘退变中的研究进展》作者王珏翰,朱策,黄勇。