单细胞测序能解决肿瘤的异质性问题2021-09-28 08:39:44
化疗和靶向治疗是除手术外肿瘤的主要治疗方式,但大多数肿瘤都存在耐药性。当前,肿瘤耐药的原因和机制研究仍存在诸多瓶颈,这使得肿瘤耐药复发成为影响癌症患者预后的一大因素。人们需要搞清楚的是耐药是源于具有耐药表型的亚克隆(固有耐药),还是通过药物诱导产生了耐药的新突变(获得性耐药)。单细胞测序能够解决肿瘤的异质性问题.通过重建肿瘤细胞进化轨迹、识别罕见亚克隆、筛选耐药相关基因来确定治疗靶点,是解决耐药问题的一个有效方法。通过持续的低剂量紫杉醇暴露,成功地诱导出食管癌细胞KYSE-30的紫杉醇耐药株。单细胞测序结果显示,耐药与不耐药细胞株具有不同的角蛋白19基因表达水平,这提示KYSE30细胞存在固有的紫杉醇耐药。此外,通过诱导获得紫杉醇抗性的紫杉醇书细胞具有蛋白酶体基因高表达而缺氧诱导因子(HIF-1)信号基因低表达的特点。这表明,蛋白酶体基因和HIF-1信号基因可能与获得性紫杉醇耐药有关,可以作为食管癌化疗新靶点。
为了评估胃肠道间质瘤的伊马替尼耐药性,在单细胞水平对肿瘤样本、耐药细胞株和短暂暴露于伊马替尼的非耐药细胞株进行分析。测序结果显示.短暂暴露的细胞株表现出较少的核酸变异和基因拷贝数的改变,但解毒相关基因上调,参与细胞周期进程的基因下调;而耐药细胞株则存在大量的基因组改变,解毒相关基因明显放大,具有细胞周期蛋白依赖性激酶活性的基因则被删除。这提示,该耐药细胞株可能最初因暴露于伊马替尼而改变了其转录反应,然后获得了对伊马替尼具有完全耐药性的次级突变。
出自《单细胞测序技术在消化系统肿瘤研究中的应用及进展》作者张路遥.时永全。
上一篇: 肿瘤侵袭和转移