全基因组扩增

将单个细胞的微量全基因组DNA进行扩增，通过外显子捕获进而高通量测序用于揭示细胞群体差异。常见的方法有聚合酶链反应法（PCR）、多重置换扩增技术（MDA）。PCR法是第一个针对SCS开发的方法但扩增效率低，MDA法已被广泛报道，从单细胞基因组或外显子组可以获得高的物理覆盖率（＞90％），这是测量碱基突变的理想方法。近年，又有一种方法，Stepanauskas等提出了一种组合 MDA 和 FACS 并改进的方法，即WGA-X。该方法增强了单个微生物细胞和病毒基因组回收效率。
 

全转录组扩增技术

全转录组扩增技术是SCS的关键步骤，RNA测序的第一步是开发有效的全转录组扩增方法。单细胞转录组扩增的方法主要有唐氏法（Tang‘s method）、Smart-seq1、Smartseq2、线性扩增法等。但SMART技术不稳定，低水平表达的转录组可能会丢失。在过去的几年里，扩增技术取得了很大的进展，单个细胞转录组扩增技术中存在的弊端逐渐被修复。
 

基因测序

利用各种测序方法，分析DNA或RNA碱基序列、基因的表观遗传修饰。
 

数据分析

数据分析是指通过各种算法对测序结果进整理筛选，从测序结果中获取有用信息的一种方法。目前单细胞测序技术仍存在多种固有技术错误，改进生物信息学分析技术是关键。随着技术不断发展，SCS技术及其在肿瘤个体化治疗中的应用前景广泛。
 

出自《单细胞测序技术及其在乳腺癌中的应用进展》作者杜彦宏，季雄娟。