２０１７年以来，分别基于Ｄｒｏｐ－ｓｅｑ和 Ｃｙｔｏ－ｓｅｑ原理的１０Ｘ Ｇｅ－ｎｏｍｉｃｓＣｈｒｏｍｉｕｍ以 及ＢＤＲｈａｐｓｏｄｙ测序平台相继问世，标志着低成本的商业化单细胞转录组测序技术时代的到来。除了这些技术，Ｓｍａｒｔ－ｓｅｑ、ＭＡＲＳ－ｓｅｑ、Ｍｉｃｒｏｗｅｌｌ－ｓｅｑ等技术也在被使用，其中Ｓｍａｒｔ－ｓｅｑ技术能够得到全长的转录本，但其局限性为低通量、高成本，近年来科学家们在此技术的基础之上不断进行改进，开发出了Ｓｍａｒｔ－ｓｅｑ２、Ｓｍａｒｔ－ｓｅｑ３技术，不断降低测序成本，提高样品处理量。目前ｓｃＲＮＡ－ｓｅｑ技术已经开发出许多分析方法，主要包括数据预处理、一般分析和探索性分析。
 

数据的预处理包括质控、比对和量化；一般分析包括低质量细胞过滤、归一化、高度可变基因选择、降维、聚类和细胞类型注释；探索性分析包括差异基因分析、功能富集、基因集变异分析、转录因子预测、细胞轨迹、细胞－细胞相互作用、细胞周期和空间转录组分析。
 

出自《单细胞ＲＮＡ测序技术在胶质母细胞瘤研究中的应用》作者宋萍，邓慧，张孟贤.