GBM内肿瘤细胞转录组的多样性2024-03-08 10:05:05
在GBM领域,基于scRNA-seq的研究有很大的进展。2014年Patel等对5例GBM样本进行scRNA-seq,揭示了GBM内肿瘤细胞转录组的多样性,此后越来越多的关于GBM的scRNA-seq研究不断开展,包括通过对GBM中的细胞进行聚类以鉴定出具有在特征基因、生物学特性、预后等方面具有差异的肿瘤细胞群体,鉴定出分布于肿瘤不同部位、出现于肿瘤发展过程中不同时段、具有不同作用的免疫细胞群体;分析癌细胞的发展轨迹以确定GBM肿瘤细胞的来源;利用基因间的表达相关性和基因的聚类来构建基因调控网络;在GBM治疗方面,通过对治疗前后免疫微环境的分析,提出解决耐药问题以及增加治疗敏感性的潜在靶点。总之,scRNA-seq技术具有阐明肿瘤发生发展机制的巨大潜力,有利于肿瘤的个体化治疗以及优化各种治疗方案,为GBM的精准治疗策略提供新的思路。肿瘤异质性是指肿瘤演进过程中分子生物学及基因方面发生的改变,从而使不同肿瘤细胞的生长速度、侵袭能力、对药物的敏感性等产生差异。GBM的异质性不仅体现在不同的患者之间,也存在于同一患者的肿瘤细胞之间,其异质性由多种因素共同驱动,如遗传、表观遗传和微环境等。不同患者的肿瘤具有不同的染色体畸变,每个患者的肿瘤细胞都有一组独特的小范围突变,这些突变划分了每个肿瘤中不同的肿瘤细胞群。scRNA-seq揭示不同患者个体间分子及免疫浸润情况的差异。既往的整体转录组研究显示GBM具有显著的瘤间异质性,GBM可以被定义为4个亚型:前神经亚型、经典亚型、间充质亚型、神经亚型。
出自《单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤研究中的应用》作者宋萍,邓慧,张孟贤.
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