EGFR突变与AC样状态的相对丰度有关2024-03-08 10:18:22
通过对单细胞公共数据库中的数据进行分析得出结论,NE可能是肿瘤边缘正常组织污染,因此将其排除在外。其余3个肿瘤亚型的基因表达、免疫微环境、肿瘤的生物学行为以及预后都不尽相同,PN、MES和CL亚型分别与血小板源性生长因子受体、Ⅰ型神经纤维瘤病和表皮生长因子受体的基因表达异常相关联,CL和MES具有更高的侵袭行为,而PN具有相关良性行为。MES评分高的患者伴随着肿瘤微环境中丰富的巨噬细胞、T细胞和内皮细胞浸润。一项基于单细胞公共数据库的scRNA-seq研究显示,不同亚型的细胞在同一患者体内的分子相似性大于同一亚型细胞在不同患体内的分子相似性,肿瘤细胞的拷贝数变异状态和调控网络在同一患者中更加具有相似性,这表明肿瘤的瘤间异质性比瘤内异质性更明显。通过scRNA-seq可以鉴定同一患者肿瘤内不同状态的肿瘤细胞以及不同状态肿瘤细胞之间基因、侵袭能力、肿瘤微环境的差异。2019年Neftel等对20个成人和8个儿童GBM的共24131个细胞进行scRNA-seq,发现GBM中的恶性细胞以神经祖细胞样、少突胶质祖细胞样、星形胶质细胞样和间充质细胞样的状态存在。
EGFR突变与AC样状态的相对丰度有关,CDK4和PDG-FRA的扩增分别与NPC样和OPC样状态的丰度相关,而Chr5q的缺失、NF1的改变、大量免疫浸润和缺氧则影响MES样状态的频率。AC样状态与MES样状态分别对应MES、CL亚型,在PN的富集评分中,NPC样和OPC样状态没有显著差异。NPC样状态是处于增殖状态的细胞,可能是肿瘤细胞的起源。MES样状态中上皮间充质转化相关基因上调,诱导免疫介质,表达高水平的免疫因子,在免疫抑制的微环境中起重要作用,从而促进肿瘤的增殖。
出自《单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤研究中的应用》作者宋萍,邓慧,张孟贤.
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