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MES-Ast与T细胞丰度和细胞毒性相关2024-03-08 10:20:35

一项scRNA-seq研究鉴定了3种不同类型的MES样状态,分别为缺氧相关的MES样状态、星形胶质细胞相关的MES样状态以及二者的中间状态。这种不同状态的形成可能与异常的免疫微环境相关。MES-Hyp优先与NF1缺失、整体巨噬细胞丰度、巨噬细胞/小胶质细胞比值和M2相关的巨噬细胞相关。相反,MES-Ast与T细胞丰度和细胞毒性相关。

肿瘤的时空异质性是指肿瘤细胞亚群在疾病部位之间和内部的遗传差异不均匀分布以及癌细胞分子组成的随时间变化而变化。既往根据多区域采样的整体转录组研究同一个体的肿瘤可为多个亚型混合模式,亚型可以随时间的推移而发生改变。而scRNA-seq研究单个细胞的状态,每个肿瘤都是由处于多种细胞状态的细胞组成的,这些细胞可能会增殖或过渡到其他状态,这是由于某些遗传因素决定了特定的过渡速率,进而定义了一个稳态分布。
 
He等发现癌细胞从周期细胞向NPC/OPC样状态再向MES样状态进化,这表明GBM癌细胞的动态进化驱动了胶质瘤的肿瘤内异质性。Wang等的研究揭示两种胶质瘤干样细胞类型:前神经干样细胞型、间充质干样细胞型。pGSCs在肿瘤前沿和浸润区域富集,mGSCs在肿瘤核心中更富集。这两种干细胞处于同一个变异轴上,间充质干细胞为前神经干细胞的祖细胞。间充质干细胞型在缺氧区富集,与不良预后相关,而前神经干细胞型则无法 预测预后。Xiong等结合Verhaak等及Wang等的scRNA-seq相 关 研究将肿瘤细胞分为PN、MES、CL、mGSCs以及pG-SCs共5种类型,mGSCs来源于ME和CL亚型,而pGSCs主要来源于PN亚型,RNA速度显示GSC亚型从间充质表型转变为神经前表型。
 
出自《单细胞RNA测序技术在胶质母细胞瘤研究中的应用》作者宋萍,邓慧,张孟贤.