Aregs表现出向成熟脂肪细胞的分化趋势2024-11-18 08:41:00
Reversed Graph Embedding算法不仅能模拟细胞的发育轨迹，同时能对细胞进行聚类以获得不同状态下的差异基因，从而分析影响分支形成的关键基因及其功能。Sárvári等通过snRNAseq技术并通过伪时序分析揭示了瘦和肥胖小鼠eWAT中脂肪细胞从早期PreAs的干细胞状态到晚期PreAs的成熟准备阶段，再到过渡状态细胞的活跃分化过程，最终形成具有脂质储存能力的成熟脂肪细胞这一详细的分化轨迹，为理解肥胖状态下脂肪组织细胞异质性及转录调控机制提供了新的视角。另外，Liu等基于snRNA-seq和scRNA-seq技术所绘制的小鼠iWAT中非免疫细胞的全面图谱，通过伪时序分析发现了在寒冷刺激下ASPCs中的Aregs表现出向成熟脂肪细胞的分化趋势，并揭示了米色脂肪细胞可能通过现有成熟脂肪细胞的转分化过程产生，特别是从表达脂质生物合成相关基因的脂质生成脂肪细胞开始，然后转化为米色脂肪细胞。此外，该研究发现了在iWAT中存在两种之前未被报道的内皮细胞亚群，即Bank1+和Skap1+内皮细胞，它们可能从毛细血管细胞发展而来，并且在寒冷条件下的数量增加。然而，伪时序分析受数据噪声和技术限制的影响，如细胞状态分布不均可能导致轨迹误判。因此，使用Monocle时需注意数据质量控制和参数选择，以确保分析结果的准确性。
肥胖病是一种全球性的流行病，与多种并发症如癌症、心血管疾病、脂肪肝、关节炎和T2DM有关。有研究采用snRNA-seq技术在小鼠附睾脂肪组织鉴定出18个细胞亚群，发现其中内皮细胞亚群的比例在肥胖发展过程中出现下降，并且识别出Prox1、Erg、Flt4、Kdr、Flt1和Pecam1等关键基因在维持脂肪组织内环境稳态及促进内皮细胞增殖方面发挥着至关重要的作用。
出自《单细胞转录组学视角下的脂肪组织异质性》作者:王永浪,陈思思,李奇隆.
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